防止腐蝕的方法很多，殺菌滅藻劑但在冷卻水系統中，最常用的是在冷卻水中投加緩蝕劑。除此以外，在冷卻水系統中，也采用電化學保護法，涂料覆蓋換熱器水側管壁等方法。
    (1)化學處理法——添加緩蝕劑  即在循環冷卻水系統中加入低劑量的緩蝕劑（又稱腐蝕抑制劑），使金屬的腐蝕受到抑制。緩蝕劑在水中的濃度一般保持在每升幾毫克到幾十毫克。是目前應用最廣泛的經濟實用方法。
    緩蝕劑的緩蝕機理可從電化學腐蝕抑制和形成金屬保護膜兩個角度來看。從電化學腐蝕角度看，緩蝕劑抑制了陽極或陰極過程，在金屬表面產生極化作用，使腐蝕電流減小，達到緩蝕作用。從成膜理論角度看，緩蝕劑在金屬表面上形成一層難溶的保護膜，阻止了冷卻水中氧的擴散和金屬的溶解。
   (2)提高運行pH值提高循環冷卻水系統運行的pH值可以降低碳鋼的腐蝕速度。這是因為天然水中均含有一定量的碳酸氫鹽及碳酸鹽，pH值提高之后碳酸鹽堿度提高了，容易在金屬表面形成碳酸鹽保護膜。同時當pH值達到8.0以上時，溶解氧就使碳鋼表面生產一層鈍化膜（γ-Fe203）。由于循環冷卻水在曝氣和提高濃縮倍數時，水的pH值會自然增長，一般在8.O～9.5之間。故可盡量在自然pH值下運行，系統中可不加酸或少加酸。
    (3)涂料覆蓋法這種方法是在碳鋼換熱器的傳熱表面或封頭上涂上防腐涂料，形成一層連續的牢固附著的薄膜，使金屬與冷卻水隔絕，避免受到腐蝕。
    (4)電化學保護法  陰極保護法。
    以上防腐方法中，(4)法不常用，(1)、(2)、(3)法均常用。可以單獨采用其中一種，也可以幾種方法共用殺菌滅藻劑。